關於玫瑰十字會的實際哲學信仰、政治抱負和人道主義活動，能派得上用場的材料並不怎麼盡如人意。這個組織的奧祕從古至今都遵照其本質而被嚴密保護；試圖破解玫瑰十字會哲學的嘗試終究只能流於揣測，而且它們有的還大相徑庭。
證據表明也許其實存在著兩個不同的玫瑰十字會：一個是內隱組織（inner organization），它的成員從未向這個世界揭露過自己的身份或教義，另一個則是受內隱組織監督的外體（outer body）。非常有可能的是，金石騎士（Knight of the Golden Stone）克里斯蒂安・羅森克魯茲的象徵性墳墓就是這個外體，它的精神處在一個更崇高的領域。在1614年後的一個世紀多裡，外體組織以自己或不同成員的名義發表了各篇論文和宣言。這些作品的用意很明顯是要混淆並誤導調查者，進而有效掩蓋玫瑰十字會的真實意圖。
當玫瑰十字主義成為17世紀的哲學“時尚”時，以這個組織為題的大量文獻也在渴望利用它的流行來大賺一筆的騙子的賣弄下橫空出世。玫瑰十字會本身就夠詭計多端，加上騙子編造的可笑文學更形同形成了雙重面紗，內隱組織在背後以某種方式暗渡陳倉，與公開宣揚的宗旨與原則迥然不同。《兄弟會自白》直白地提到了它們顯然有理由允許存在的這些誤解，這被它們稱為“雲彩”，方便了它們在幕後行事而不被人知。
對於玫瑰十字主義的實質內容——即其秘儀教義——的線索其實可以從分析它的雲影——也就是那些顯白的著作來抽絲剝繭。在它們最重要的其中一朵“雲”《自白》中，玫瑰十字會試圖為自己的存在進行辯護並解釋該組織的目的和活動。原版的《自白》共有十四章，以下將擷取重點來討論。
《兄弟會自白》
第一章：切勿倉促判斷或偏頗曲解了我們先前發表的宣示——《兄弟會傳說》的內容。耶和華看見了文明的頹廢之虞，祂試著透過向願聽的人揭示這個危機來挽救人類，但那些不願聽的人也得被迫接受祂以前為自己的選民保留的秘密。藉著這智慧，虔誠的人必能得救，但不虔誠的人的憂慮只會不減反增。雖然我們組織的真實願景已經被《兄弟會傳說》大白於世，但隨之產生的誤解卻指責我們是異端邪說與妖言惑眾。在這份文本中，我們希望能夠澄清我們的立場，我們期盼的是歐洲的知識份子能夠加入我們，根據我們傑出創始人的願望一起傳播神聖的知識。
第二章：儘管有很多人都以為我們這個時代的哲學思想足夠健全，可是我們得宣布它是不實的，而且很快就會因為自身的缺陷而亡。然而，正如大自然對每種疾病都提供了對症下藥之道，所以我們的兄弟會也向世界哲學體系的不足提出了補救。玫瑰十字會的秘密哲學是建立在所有首屈一指的學院、科學以及技藝的知識總全之上。通過我們的神聖揭示體系——它涉及很多神學和醫學，但只有些微的法學——我們解析天國與塵世；不過我更多研究的還是人自身，至高無上的秘密就隱藏在他的本質中。如果博學之士能夠接受我們的邀請，加入我們的兄弟會，那我們便會向他們展示他們此前從未想過的，關於自然界隱蔽運作的另一面的奧祕和奇蹟。
第三章：不要覺得這份簡短的文件所討論的秘密在我們看來只是九牛一毛。我們不能太過巨細靡遺地描述我們兄弟會的奇蹟，以免我們石破天驚的發言令那些無知之人感到不堪重負，反而讓他們可悲地嘲笑起自己不能理解的奧祕。我們還擔心很多人會因我們的布告居然如此知無不言而備感困惑，這不過是因為他們不清楚發生在這第六個時代的奇蹟，並且他們也沒有意識到即將到來的巨變。這就好比盲人即便生活在一個光明璀璨的世界，他們也只能憑藉感覺來意會（此處的視覺暗示靈性知覺，感覺指的是物質知覺）。
第四章：我們堅信，透過對人類思想發明與生命奧祕的深刻冥思、透過與天使和聖靈的合作、透過經驗跟長期觀察，我們愛戴的基督徒先父C.R.C必能普照上帝的智慧，那涵蓋了這個世界失去的所有典籍和著作，科學的根基也會被推翻，屆時玫瑰十字會就可以根據神聖的真理與正直之基礎來重塑這個世界的思想結構。由於我們的知識如此深邃且完善，那些渴望瞭解玫瑰十字會奧祕的人往往無法一蹴可就，而是必須依著理解與知識程度來循序漸進。因此，我們的兄弟會分成了幾個等級，每一個都要按步就班地朝著大奧祕上升。既然慈愛的上帝願意用祂的第六個燭台來照明我們，那麼以這種方式來追尋真理，豈不是比繼續徘徊在世俗的無知迷宮更好嗎？
再者，那些接受這種知識的人還將成為各樣藝術與技藝的大師；對他們而言再也不會有任何秘密；而且過去、現在、未來的所有偉大著作都將讓他們飽覽。整個世界都將化為一本大書，科學和神學的矛盾也會得到調和。噢，人類，歡喜吧！現在上帝已經下令是我們兄弟會開始拓展的時候了，我們將滿懷欣喜地展開工事。智慧的大門如今已向世界敞開，但只有那些享有特權的人才可以向兄弟們介紹自己，因為我們甚至都不能把我們的知識傳授給自己的孩子。接受靈性真理的權利無法被繼承：它只能藉由人自身靈魂的成長來得到。
第五章：儘管我們也許會因為如此自由且慷慨地分送我們的寶藏而被指責太過輕舉妄動——沒有仔細區分誰虔誠、誰智慧、誰是王子、誰是農人——但我們保證我們沒有背叛一切信任；即便我們以五種語言發表了我們的《傳說》，但僅有那些能夠理解的人才會享有這個權利。我們的組織不會區區好奇心旺盛的尋求者發現，唯有那些嚴肅而莊嚴的思想家才能做到；話雖如此，我們還是決定用五種語言來傳播我們的《傳說》，以便所有國家的義人都有機會瞭解我們，就算他們不是學者也無妨。不配的人可能會大吵大鬧個千百遍，他們會有千言萬語要說，但上帝已讓我們的雙耳無法聽見他們的喧嘩，並用祂的雲彩覆蓋住我們，那是祂的僕人，沒有任何暴力可以在此作亂；因此再沒有任何一雙眼睛可以看見我們，除非他們從老鷹那裡獲得了力量。我們要進一步發誓，我們將被達姆卡的哲學家採用的體系來改革歐洲政府。所有渴求獲得知識的人都應該盡可能地量力而為。虛偽的神學統治必被罷黜，上帝將透過祂選好的哲學家來顯明祂的意志。
第六章：為了簡言而之，我們可以說我們的先父C.R.C出生於1378年，並在一百零六歲時歸天，他把向全世界宣揚這個哲學式宗教的教義的工作留給了我們。我們的兄弟會向所有誠心尋求真理的人張開雙臂；但我們亦要公開告誡他們絕不能虛情假意和心有不敬，背叛或傷害我們，因為上帝保護著我們的兄弟會，所有心懷不軌的人最後都會惡有惡報，與此同時我們兄弟會的寶藏卻會絲毫未損，讓猶大之獅來建立他的王國時能用上。
第七章：我們宣布，在世界末日到來之前，上帝將創造大量的屬靈之光來減緩人類的苦難。虛假與黑暗已經悄悄滲透入人類的藝術、科學、宗教還有政府——嚴峻的情況甚至使得智者都難以發現真實之道——這些東西都應該被一勞永逸地根除，然後在訂立一套可以讓眾人都分享真理果實的單一標準。我們不會被認為是這場變革的功臣，人們會說這都是時代進步的結果。就在眼前的改革是無與倫比的；但我們玫瑰十字會不會因這場神聖改革的榮耀而妄自尊大，因為有許多人雖然不是我們兄弟會的成員，可是這些誠實、正值且智慧的人的睿智和著作卻加速了它的到來。我們要說，要是這些磐石能越早出頭並一展大才，那樣就不怕沒有人在地上執行上帝的旨意了。
第八章：無人可議，我們宣布上帝已經派遣了天上的使者和徵兆，這即是蛇夫座與天鵝座的新星，這表示一個偉大的選民議會已經準備就緒。這是上帝在有形世界中的啟示——對於眼光犀利的少數人——所有即將發生的事情其實都有跡象和符號可循。上帝給了人兩隻眼睛、兩個鼻孔和兩隻耳朵，但只有一個舌頭。雖然眼睛、鼻孔和耳朵都能將大自然的智慧接入心中，可是只有舌頭才能發出它。不同時代都有見過、聞過、品嚐過或聽過上地旨意的先賢，不久後那些見過、聞過、品嚐過或聽過的人就會開口，真理也隨之顯露出來。然而，在這正義的啟示成為可能之前，這個世界需要先陷入沉睡來擺脫她的有毒聖杯的毒害（虛偽神學之苦），而且還要向美德和理解打開她的心扉，歡迎真理的太陽冉冉升起。
第九章：我們擁有一部魔法典籍，它是騰抄自神聖的字母表，上帝就是用它來將祂的旨意刻寫在天上與地上的自然界面貌上。通過這種新語言，我們讀懂了上帝對祂的所有造物的意志，這就像天文學家預測日蝕，我們也預言教會會漸漸每況愈下並能苟延殘喘多久。我們在墮落前所用的是和亞當與以諾相似的語言，而且即使我們能夠用這神聖語言來理解和解釋我們的奧祕，我們卻無法憑拉丁文來如此，畢竟它已被巴別塔的混亂所污染。
第十章：雖然仍有ㄧ些手握權勢的人反對並阻撓我們——因而我們必須銷聲匿跡——我們奉勸那些將成為我們兄弟的人一定要持續不懈研究《聖經》，只要能夠持之以恆，他們就離我們不遠了。我們這話的意思不是一個人應該對《聖經》循誦習傳，而是他應該試著去發掘其中真實且永恆的意義，這是神學家、科學家或數學家都鮮少發現的，因為都被各自的成見蒙蔽了雙眼。我們見證了從世界誕生以來還未有過一本書能比《聖經》更好。擁有它的人有福了，閱讀它的人更是福上加福，最幸福的人還是真正理解它的人，最神聖的則是遵從它的人。
第十一章：我們希望我們在《傳說》中就嬗變金屬和萬靈藥的陳述能夠被淺嘗輒止。縱使我們意識到這兩件事對人而言都是可行的，但我們仍擔憂如果他們都太專注在研究該如何嬗變金屬，那許多真正偉大的思想家反而可能會因此與真正的知識與理解失之交臂。當一個人有能力治癒疾病、克服貧困並取得高尚的地位時，那個人接著就會被無數的誘惑侵擾，除非他擁有真正的知識與理解，否則他會變成人類最可怕的威脅。曉得該如何提鍊賤金屬的煉金術士除非擁有與他自我創造的財富一樣多的理解，否則他將會作惡多端。所以，我們可以肯定人必須先獲得知識、美德和理解；如此其它東西才可以交予他。我們指責基督教會的大罪是手握重權卻無法明智運用；因此我們預言總有一天它也得天道好還，它的冠冕要在頓時間化為烏有。
第十二章：在結束我們的《自白》之前，我們要懇切地告誡你們應儘早拋棄那些一文不值的偽煉金術士和哲學家（這些人在我們這個時代到處都是）的著作，他們對神聖的三位一體充滿輕蔑，還用毫無意義的閃爍其詞來欺騙耳根軟的人。舞台演員是這些人中的佼佼者之一，這就是一種擁有足夠的聰明才智去索求的人。這些與人類的福祉之敵狼狽為奸的人往往混雜在那些尋求行善的人之中，這使得真理的發現變得難上加難。請相信我們，真理是純粹且不隱瞞的，而虛假則複雜、深藏不露、自負，它虛構出來的世俗知識只是看上去散發著神聖光彩，那經常被誤以為就是神聖的智慧。有智慧的人會離開這些虛假的教誨，轉而來找我們，我們不貪求你們分文，反而願意無償向你們提供我們更大的財富。我們對你們手上的東西毫無貪慾，但你們卻應該來分享我們手上的東西。我們不會對比喻冷嘲熱諷，但卻要邀請你們來理解所有比喻與秘密。我們不要求你們接待我們，但卻要邀請你們到我們的王室和宮殿來，這不是出於我們自己的旨意，而是上帝之靈就是如此命令，這就是我們最出色的先父C.R.C的願望，同時也是如今這一刻最偉大的需要。
第十三章：我們已明確表示我們真誠地信奉基督，否認教權；我們把生命奉獻給真正的哲學跟值得的生活；我們每天都在邀請各國的有幸之人加入我們兄弟會，並與我們一同分享上帝之光；難道你們不願和我們一起使自己臻至完美，融會貫通所有技藝，然後為世界服務？如果你們願意加入，世上各地的財寶都會在時候到來時賜給你們，籠罩人類知識的黑暗及其導致的虛榮的物質技藝與科學必將永遠消失。
第十四章：我們要再次警告那些被黃金的燦爛所迷惑的人，或是那些本來過著無所事事和愛慕虛榮生活，卻因著巨大的財富所以現在才想裝得耿直的人，少用他們的喧囂來打擾我們神聖的沉默；雖然確有一種靈丹可以治癒一切疾病並給予眾人智慧，但這違背了上帝的旨意，祂期望人們能通過美德、勞動和正值來達到這種理解。我們不被允許向任何人現身，除非是上帝所允。那些相信自己可以違背上帝旨意、分享我們的靈性財富而不會被祂懲罰的人，最後只會發現他們很快就會耗盡一生在尋找我們，而非為此獲得幸福。
——玫瑰十字會
約翰・瓦倫廷・安德烈通常會被相信是《自白》的作者，然而這一論斷卻不是沒有爭議，包括安德烈是否允許弗朗西斯・培根假託他的名字。探究這個主題有兩個極其重要的參考線索，首先出現在《憂鬱的解剖》（The Anatomy of Melancholy）這部文學傑作的導引中。在1621年首度出版的這部作品的作者是小德謨克利特（Democritus Junior），他後來又被確認就是羅伯特・伯頓（Robert Burton）再往後又有懷疑培根才是真正作者。其中有一處段落暗示，在《憂鬱的解剖》出版於1621年時，玫瑰十字會的創始人尚在人間。這段陳述——一般都被正文給蓋過了風頭——居然逃過了大部份玫瑰十字主義研究者的注意。同一本書的另一處還出現了一個非常重要的簡短腳註。它這麼寫著：“雅各・瓦倫丁・安德烈，維魯蘭男爵。”（Job. Valent. Andreas, Lord Verulam）這條線索顯然將約翰・瓦倫廷・安德烈和身為維魯蘭男爵的培根聯繫在了一起，而且標點符號還暗示他們是同一個人。
約翰・瓦倫廷・安德烈，引自一幅難得的版畫。
在某些秘儀圈子中有謠傳正是約翰・瓦倫廷・安德烈的為人謙遜掩蓋了他是玫瑰十字會的崇高使者的事實。儘管有充分的證據可證明確有這位名叫安德烈的德國神學家，但他的傳記多有矛盾之處，為使批判性的研究者滿意這些都已被清理乾淨。即使因為年齡而有所差異，但上圖描繪的臉部特徵仍與培根有驚人的神似。如果培根曾借用威廉・莎士比亞的名字與身份，那他自然也可以在他舉辦於英國的假葬禮結束後，繼續以約翰・瓦倫廷・安德烈的身份生龍活虎。他胸部下面的新月符號特別重要，因為它也出現在了培根的徽章上；這表示他是尼古拉斯・培根爵士（Sir Nicholas Bacon）的次子。此外，通過非常簡單的培根式密碼（Baconian cipher），版畫右下角的四個字母（O MDC）可以被轉變成數字，其總和是33——與培根的名字等值。一旦能夠綜上所述，圍繞第一份玫瑰十字宣言的作者的迷霧就又被釐清了一些。
在玫瑰十字會的辯護者中有一個才俊叫做約翰・海頓（John Heydon），他以“上帝的僕人和大自然的秘書”自居。在他引人求知的著作《揭祕玫瑰十字會》（The Rosie Cross Uncovered）裡，他以如下字句對玫瑰十字會給出了一段高深莫測但很有價值的描述：
“現在有這麼一群人，就如他們自己所述，他們自稱為玫瑰十字會員，這是一個生活在天國城郊的神聖兄弟會，這些人是世界大元帥手下的官員，就好似一位偉大國王的眼睛與耳朵，可以看見並聽聞一切：他們說玫瑰十字會員是熾天使般的啟蒙者，就像摩西，元素也是依照這種順序所行，土淨煉水、水淨煉氣、氣淨煉火。”
自然界運行的符號化圖示，引自弗拉德《作品集》。由德・布里（de Bry）雕刻的這幅版畫是最著名的闡述了羅伯特・弗拉德的哲學原則的示意圖。在玫瑰十字主義與共濟會之間，有三個人擔當著重要的聯繫：米歇爾・邁爾、伊萊亞斯・阿什莫爾和羅伯特・弗拉德。德・昆西還相信羅伯特・弗拉德是共濟會的直系祖宗（參見《玫瑰十字會員和共濟會員》〔The Rosicrucians and Freemasons〕）。愛德華・偉特也認為羅伯特・弗拉德是帕拉塞爾蘇斯最入室的弟子，甚至青出於藍更勝於藍。他進一步補充說：“玫瑰十字會文學的核心人物是一位位居所有演說家、神智學者、偉大工作的冒名教授之上的智識巨人，這個人直接或間接與神秘兄弟會有所牽扯的人就是17世紀的神秘哲人羅伯特・弗拉德，他學識淵博、思想高尚並且根據他自己的著作，同時亦為人聖潔。”（參見《玫瑰十字會的真實歷史》〔The Real History of the Rosicrucians〕）羅伯特・弗拉德出生於1574年，後在1637年逝世。
德・布里透過上圖表達的含義可謂不言而喻。在滿天星斗的天穹之外是最高天的三層火圓——至高造物主的三重火焰——天國的生命就居於其中。在祂之內的星斗是代表行星和元素的圓環。緊接在氣元素之後的是世界之圓（土）。在動物之環後面的是植物之圓，再接著是祂的礦物之圓。接下來出現的是各行各業，在最中間則有一個猿人坐在地球儀上，他還在一邊拿著圓規測量手上的球體。這個小人代表的是動物的創造。在外面的火圓，佇立在最上方的是被雲彩包圍的耶和華的聖名。從這堆雲彩中伸出了一隻握著鏈條的手。在神聖的領域與以猿人表示的低級世界之間有一位女性。值得注意的是，這個女性握住的鏈條把她和低級世界聯繫在一塊，但來自上級世界的鏈子也束縛住了她的一隻手腕。對於這個女性形象有很多種解釋：她或許意味神性與獸性間的人性；她也可能代表上帝和低級世界彼此的自然界紐帶；又或者她其實是人類的靈魂——上級與下級世界的交匯點。
他還進一步宣稱，這群神秘的兄弟擁有多種多樣的能力，可以隨意以任何面貌現身。在同一部作品中，他列舉了玫瑰十字會員的稀奇力量：
“我將在這裡為你揭開玫瑰十字會員的廬山真面目，摩西是他們的父親，而且他還是主的僕人（Θεοῦ παῖς）；有些人聲稱他們是以利亞的徒子徒孫，又有人說他們是以西結的門徒；這是因為玫瑰十字會員看起來不僅僅挪用了摩西的理論，而是就連摩西、以利亞、以西結以及後來的先知行過的奇蹟力量都為他們所熟知，令他們可以隨意在各地穿梭，就像從猶地亞跑到巴比倫的哈巴谷，為閹人施洗後前往阿佐魯斯的腓力，在這些人中還有一個傢伙跑到德文郡去找了我的一個朋友，並在為期四天的旅行途中帶著口信到倫敦找我；他們用對星象和地震一字不差的預測使我折服、他們制住了肆虐城市的瘟疫、他們令狂風與暴風雨沉默、他們平息了海洋和河流的憤怒、他們行走在空中，挫敗居心叵測的巫婆，而且他們還治癒了諸種疾病。”
一向被認為最重要的玫瑰十字會文學是約翰・海頓的作品。約翰・海頓可能與“受熾天使般啟蒙的玫瑰十字會員”克里斯多福・海頓爵士（Sir Christopher Heydon）有關，雷伊・加德納（F. Leigh Gardner）相信後者應該是他的玫瑰十字會知識的來源。他在《玫瑰十字會圖書館》（Bibliotheca Rosicruciana）中就約翰・海頓寫道：“總而言之，從他的作品的內部證據看來，他似乎已經是玫瑰十字會的低級會員，而且他以盡其所能向這個世界講述了他所知。”約翰・海頓遊歷四方，他造訪過阿拉伯、埃及、波斯和歐洲各地，這些經歷都與他的作品《與天使、行星、金屬等同遊的智者之冠，或玫瑰十字之榮耀》（The Wise-Mans Crown, Set with Angels, Planets, Metals, etc., or The Glory of the Rosie Cross）息息相關——他宣稱這部作品就是當年克里斯蒂安・羅森克魯茲從阿拉伯帶回的神秘M書的英譯本。
托馬斯・禾根是這個組織的另一個辯護者，他也證實了約翰・海頓所云玫瑰十字會員擁有隨意隱形的能力：
“玫瑰十字會的人可以在這片白霧中來回。‘無論是誰想與我們溝通，要嘛他可以找對方法，否則除非是我們願意，不然他永遠也見不著我們。’”
玫瑰十字會是這麼一個莊嚴而崇高的組織，其可以隻手擺佈煉金術、卡巴拉、占星學和魔法的象徵符號來為自己所用，但卻又完全獨立於那些專門使用這些術語的教派。玫瑰十字會抱有的三個主要目標分別是：
1. 廢除所有君主制政體，代之以選賢與能。如今的民主制度就是玫瑰十字會努力與專制統治抗爭後的直接結果。在18世紀初，玫瑰十字會員開始將他們的注意力轉向新興的美洲殖民地，它們後來便變成了這個新世界的偉大國家的核心。美國獨立戰爭他們史無前例的偉大政治實驗，最終這造就了一個以神聖原則與自然法為基礎的國家政府。作為對他們的秘密（sub rosa）活動的無可磨滅的提醒，玫瑰十字會員留下了美國國璽。玫瑰十字會員也是法國大革命的煽動者，但由於革命者的狂熱主義愈演愈烈和恐怖統治隨之而來，所以這次嘗試沒有盡如人意。
2. 對科學、哲學和倫理進行全面改革。玫瑰十字會員聲稱物質技藝和科學都只是神聖智慧的陰影，而人唯有穿透入自然界的最深處才能夠實現並理解這智慧。儘管以基督徒自居，玫瑰十字會員卻顯然是柏拉圖主義者，並且對早期希伯來跟印度神學最深刻的奧祕也瞭然於懷。無可否認的證據證明，玫瑰十字會員渴求復興古代神秘學派，因為這是指導人類理解秘密且永恆的教義的最一流方法。事實上，很可能自己就是古代神秘學派的長久擁護者的玫瑰十字會員必須對他們的花招絕對保密並夠足智多謀，如此才能對抗基督教的教條化勢力。他們對至高奧祕——三重自我（Three Selves）的身份和相互關係——是如此謹慎地維護與保存，所以他們絕不會向任何不合意的人透露關於這個組織的存在或宗旨的任何確切信息。透過其外部組織，玫瑰十字會逐漸創造了一個環境或外體，傑出的玫瑰十字會兄弟便投身人世，為兄弟會的偉大精神付諸實踐。
煉金術中的雌雄同體人，引自《哲人之眾》（Turba Philosophorum）。
《哲人之眾》是最早的拉丁文煉金術文獻之一，它的確切起源迄今未明。它有時也被稱為《第三次畢達哥拉斯大會》（The Third Pythagorical Synod），這本書顧名思義收錄了很多聖賢，並闡述了許多早期希臘哲學家對煉金術的觀點。上圖是引用自在1750年的德國出版的一本罕見的《哲人之眾》，雌雄同體人在這裡代表的就是偉大工作。自然界的積極性與消極性原則通常被由男人和女人來表現，當這兩個原則在同一個本質或身體中和諧交融時，這種完美平衡的狀態就時常會被以上面的這個複合形象來寓意。
3. 為各式各樣的疾病尋找萬靈藥或仙丹。有證據指出玫瑰十字會員在追求生命靈藥這方面的確有所建樹。在他的《大不列顛化學劇場》（Theatrum Chemicum Britannicum）中，伊萊亞斯・阿什莫爾聲稱玫瑰十字會員在英國並不受歡迎，但歐洲大陸倒是對他們喜聞樂見。他還指出，伊麗莎白女王曾兩次生病被玫瑰十字會員治好，罹患痲瘋病的諾福克公爵（Earl of Norfolk）亦曾被一位玫瑰十字會醫生所救。接下來一段引述自約翰・海頓的話又提到，玫瑰十字會員掌握了壽元無量的秘密，但不能超出上帝所許的時間：
“最後，他們更可以通過同樣的方法來讓每一位已經死去的兄弟重獲新生，進而繼續活上許久；你可以在第四卷書裡找到這個法則。以這種方式開始的玫瑰十字會最初有四個人，他們曾經死過但又隨著基督的降生復活，那顆星星引導著他們來到猶地亞的伯利恆作敬拜，我們的救主那時正被他的母親抱在懷裡；然後他們各自打開自己帶上的珍寶並為他獻上禮物，有黃金、乳香和沒藥，之後他們就遵循上帝的旨意回到了他們的居所。這四個年輕人就這樣生活了數百年，他們靠著一部大辭典締造了一門魔法語言與作品，而我們每天也都在使用這部辭典來讚美並榮耀上帝，並在其中發現大智慧。現在，玫瑰十字會的兄弟們正在一個再好不過的子宮裡復甦，他們已下定決心要吸引更多人來加入他們的兄弟會。”
以玫瑰十字會為題的扉頁，引自梅爾（Michael Maier）《皮亞特里厄姆》（Viatorium）。
米歇爾・梅爾伯爵是魯道夫二世（Rudolph II）的醫生，也是玫瑰十字會論戰中的醒目人物。他無需多疑是玫瑰十字會員，他並被這個組織允許去向歐洲的哲學選民宣揚其秘密。上圖的扉頁顯示了被適當的角色代表的七顆行星，每個角色的身後都有一個小小的標誌，那是行星所有的黃道符號。位在扉頁最上面的是學富五車的梅爾本人的肖像。這本書探討的是七顆行星的性質與影響，而且從頭到尾都貫穿著煉金術術語。米歇爾・梅爾對他的知識做了極為狡詐地隱藏，這使得要從他的作品汲取他擁有的所有秘密變得相當困難。他使用的符號非常豐富，他的哲學知識大部份也藏在他的書收錄的版畫中。
此處提到的子宮顯然是指安葬兄弟們的玻璃棺材或容器，這種東西也被叫做哲人蛋（philosophical egg）。經過一段時間之後，哲學家會打破他的蛋殻，出來活動一陣子便又再次回到玻璃殼去。玫瑰十字會用來治癒所有人類疾病的藥物可以被理解為是一種化學物質，它可以產生如前所說的物理效應或觸發靈性理解——這是真正的治癒力量，一個人只要能享有它就能夠洞悉真理。無知是最為嚴重的疾病，正因如此：治癒無知可說是最貨真價實的良藥。玫瑰十字會的靈藥既適用於所有國家、種族也包括每一個人。
在一份沒有發表的早期手稿中，一位匿名的哲學家聲稱煉金術、卡巴拉、占星學和魔法原本都是神聖的科學，但因為歪曲所害，結果它們都變成了虛假的學說，令尋求智慧的傑出尋覓者離他們的目標越來越遠。同一位作者還透過將靈性成就之道分為三個步驟或學位，這被他自己稱為山，從而提供了一把認識深奧的玫瑰十字主義的貴重鑰匙。這幾座山中的第一且是最矮的一座是索菲亞山（Mount Sophia）、第二座是卡巴拉山（Mount Qabbalah）、第三座是賢士山（Mount Magia）。這三座山象徵著靈性成長的幾個階段。這位匿名的作者繼續說道：
“哲學理當被理解為自然界如何運作的知識，有了這種知識，人就可以攀登超出感官侷限的那些更高的山脈。卡巴拉應當被理解為天使或天人的語言，掌握它的人便能夠與上帝的使者言談。在最高的山上有賢士學院（這是神聖魔法，上帝的語言），人會在那裡被上帝親自教導萬物的真實本質。”
現在人們愈發相信，倘若玫瑰十字主義的真相被洩露，那麼它肯定會引起軒然大波。玫瑰十字會的象徵符號有多種含義，但其中的玫瑰十字會含義卻始終未被揭示。那座聳立著玫瑰十字之屋的高山至今仍被白雲遮掩，兄弟們就是藉以來把他們自己和他們的秘密都掩藏起來。米歇爾・梅爾就寫道：“《傳說》與《自白》所言千真萬確。說兄弟會已經承諾了這麼多但卻做得這麼少是一個非常幼稚的批評。與其它地方一樣，他們看上去人很多，但其實真正被選中的少。這個組織的大師們拋出玫瑰作為千里迢迢的獎勵，但他們只把十字架施加給那些確實進來的人。”（參見梅爾《沉默致喧囂》〔Silentium post Clamores〕和德・昆西《玫瑰十字會員和共濟會員》）
玫瑰和十字架也出現在了利奇菲爾德的查普特宅邸（Chapter House）的彩色玻璃窗上，沃爾特・康拉德・阿倫斯伯格（Walter Conrad Arensberg）相信培根和他的母親就是下葬在此地。一朵玫瑰被釘在心上的圖案還被編入了1628年版的羅伯特・伯頓的《憂鬱的解剖》的致謝中。
基本世界，引自《赫耳墨斯文集新編》。
最外圓包含了黃道的形象；第二個圓圈是它們的專屬符號與它們主宰的人體部位；第三個圓圈是一年中的月份，以及對於不同氣質的簡短說明等等。第四個圓圈涵蓋了元素及其相應的符號，接續而來的七個圓則代表行星的軌道；還有行星天使，他們是宇宙士（Universal Man）的七個主要部位，還有七種金屬，每個都根據出現在第四個圓圈裡的元素名稱而歸屬在ㄧㄧ對應的下面。在第十二個圓圈上面有一行話：“有三個原則、三個世界、三個紀元、三個王國。”在第十三個圓圈中出現了被認為對靈性成長或不可缺的十二種技藝和科學的名目。第十四個圓圈上有的是大自然這個詞彙。第十五個圓圈如此寫道：“這對忠實的靈魂而言是一種榮幸，他們從出生的那一刻起就會受到指定的天使守護，每個人都有一位。”（參見最早的英譯本，倫敦，1893）
玫瑰十字會員的基本符號就是玫瑰與十字架；玫瑰代表女性，十字架代表男性，兩者都是通用的生殖器崇拜標誌。即使托馬斯・英曼、哈格雷夫・詹寧斯、理查德・佩恩・奈特這些飽學之士都注意到了玫瑰和十字架是在隱喻生殖過程，可是這幾位學者似乎都無法破除象徵主義的面紗；他們沒有察覺到物質世界中的創造性奧祕僅僅是靈性世界中的神聖創造性奧祕的倒影。由於符號具有的生殖器崇拜的意義，玫瑰十字會員跟聖殿騎士皆曾被莫須有地指控在秘密儀式中行淫穢之事。儘管煉金術的子宮象徵確實很重要，但第二次出生（second birth）這個寓言卻隱藏著更深遠的含義。由於生殖是物質存在的關鍵，所以玫瑰十字會採用彰顯生殖過程的符號是十分合乎情理的。由於重生是精神存在的關鍵，因此它們將象徵意義奠定在玫瑰與十字架身上，這寓意的是人因為自己較低的會朽本性與更高的不朽本性的結合而獲得救贖。玫瑰十字也是一個象形符號，它代表了萬靈丹的公式。
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